Wie auch die Vorgänger, entführt auch Divinity 2 den Spieler nach Rivellon, einer vom Krieg vernarbten Welt, voller Abenteuer, Magie und Geheimnissen.
Keiner der großen Kriegsherren, welcher schwor Rivellon zu schützen, konnte den mächtigen Herr des Chaos in die Knie zwingen. Sie mussten zusehen wie Freunde und Familie schreckliches Leid ertragen mussten, ihre Städte wie auch ihr Glaube verbrannten. Auch wenn die Verluste hoch waren, konnten die Armeen Rivellons durchhalten. Jedoch war kein Sieg von Dauer. Stets bereit zum Kampf, mit der Gewissheit das Hass und Verderben eines Tages zurück kommen mag, rüsteten sich die Völker.

Der neue Teil beginnt mehr als 100 Jahre nach Beyond Divinity. In der noch immer von den apokalyptischen Kriegen zerrütteten Welt, beginnt der Held sein Abenteuer. Aufgrund seiner Amnesie fehlen ihm jedoch jegliche Erinnerungen. Die Geschichte nimmt eine einschlagende Wendung, als eine blonde Frau auftaucht, die unserem Helden erklärt, dass es in Rivellon viel zu tun gibt und nur er die Dinge ins Rollen bringen kann. Damit die Welt befreit werden kann, muss der Held jedoch eine Aufgabe bewältigen und den Weg des Drachentöters einschlagen. Um diese Aufgabe zu bewältigen muss er sich in das Dorf Farglow begeben und eine gefährliche Ausbildung absolvieren. Anders als geplant bekommt der Held jedoch schon nach kurzer Zeit die Aufgabe, zusammen mit seinem Meister, einen Drachenritter zu töten. Dieser mysteriöse Krieger besitzt die Fähigkeit sich in eines der gefährlichsten Wesen in ganz Rivellon zu verwandeln, in einen Drachen. Gemeinsam bewältigen Meister und Schüler diese Aufgabe. Kurz bevor der mysteriöse Ritter stirbt, gehen die Fähigkeiten auf unseren Helden über. Nun wird dieser zum Gejagten. Durch die Erinnerungen des Drachen, erlangt auch der Held nach und nach seine Erinnerungen wieder zurück.